.img/.hdr格式转.nii格式的操作

MATLAB转格式,需要使用spm package(https://github.com/neurodebian/spm12).

%%img2nii.m--------------------------------------------
%Script to convert hdr/img files to nii.
%This script uses SPM function, so you need to install SPM5 or later.
%Kiyotaka Nemoto 05-Nov-2014

%select files
f = spm_select(Inf,'img$','Select img files to be converted');

%convert img files to nii
for i=1:size(f,1)
 input = deblank(f(i,:));
 [pathstr,fname,ext] = fileparts(input);
 output = strcat(fname,'.nii');
 V=spm_vol(input);
 ima=spm_read_vols(V);
 V.fname=output;
 spm_write_vol(V,ima);
end

附加一下volume data是如何转surface data的吧…

wb_command -volume-to-surface-mapping ArticParcels_Smithetal.nii /home/murphyhuang/tmp/nii/HCP_fMRI/Q1-Q6_R440.L.flat.32k_fs_LR.surf.gii outL.shape.gii -trilinear

补充知识：数据读取——（.img .hdr）

1、定义

该图像格式含有两部分：一个是图像 ‘.img '，另一个是图像头文件 '.hdr'，该文件记录了图像的信息，如图像尺寸、波段数、数据类型和大小端等。如果缺少头文件，将无法对图像进行读取，因此头文件十分重要。

2、读取

使用Matlab中NifTi包读取。

eg：

img=load_nii(‘D:\a01_101_bmask.hdr')

以上这篇.img/.hdr格式转.nii格式的操作就是小编分享给大家的全部内容了，希望能给大家一个参考，也希望大家多多支持python博客。